Den ble besøkt av den berømte skotske utforskeren og misjonæren dr. Livingstone, og blir derfor av engelsktalende folk noen ganger kalt «Livingstone's Lake».
Innsjøen er ca. 560 kilometer lang og 75 km bred på det bredeste, med en total overflate på ca. 29 600 km², og grenser mot Mosambik, Malawi og Tanzania. Den renner ut i Shireelva, og dens største kilde er Ruhuhu.
Malawisjøen ligger i Riftdalen, og ble trolig dannet for ca. 40 000 år siden.
Det finnes mange arter av ciklider som er endemiske til Malawisjøen, blant andre Melanochromis auratus. På grunn av dette er Malawisjøen nasjonalpark erklært som verdensarvområde.