Koenigmuseet (tysk: Zoologische Forschungsmuseum Alexander Koenig (ZFMK) eller Museum Koenig) i Bonn er et naturvitenskapelig museum med leddyr og virveldyr som spesiale. Museet ble stiftet av professor Alexander Koenig (1858-1940) som i 1929 overlot museet til det offentlige. Museet er medlem av Leibniz-selskapet, en sammenslutning av tyske forskningsinstitusjoner. Det parlamentariske råd som i 1949 vedtok Tysklands nye grunnlov Grundgesetz, holdt sine møter i museet.